国家（全国）重点实验室
石油化工分子转化与反应工程全国重点实验室
国家工程技术研究中心
国家可信嵌入式软件工程技术研究中心
国家野外科学观测研究站
国家级国际联合研究中心
国家可信软件国际联合研究中心
教育部重点实验室
脑功能基因组学教育部重点实验室 地理信息科学教育部重点实验室
极化材料与器件教育部重点实验室 青少年健康评价与运动干预教育部重点实验室
统计与数据科学前沿理论及应用教育部重点实验室 数学与工程应用教育部重点实验室（筹）
教育部工程研究中心
纳光电集成与先进装备教育部工程研究中心 软硬件协同设计技术与应用教育部工程研究中心
区块链数据管理教育部工程研究中心（筹）
教育部国际合作联合实验室
可信软件国际合作联合实验室
绿色大河三角洲国际合作联合实验室（筹）
教育部野外科学观测研究站
长江三角洲河口湿地生态系统教育部野外科学观测研究站
教育部战略研究基地和高等学校软科学研究基地
民政部重点研究基地
国家新闻出版署重点实验室
出版融合发展（华东师大社）重点实验室
自然资源部重点实验室
自然资源部工程技术创新中心
自然资源部大都市区国土空间生态修复工程技术创新中心
自然资源部野外科学观测研究站
自然资源部浙江舟山岛屿生态系统野外科学观测研究站（筹）
上海市重点实验室
上海市脑功能基因组学重点实验室 上海市绿色化学与化工过程绿色化重点实验室
上海市调控生物学重点实验室 上海市核心数学与实践重点实验室 上海市多维度信息处理重点实验室 上海市心理健康与危机干预重点实验室
上海市工程技术研究中心
上海分子治疗与新药创制工程技术中心 上海数字化教育装备工程技术研究中心
上海市工程研究中心
上海市大数据管理系统工程研究中心
上海市野外科学观测研究站
长江三角洲河口湿地生态系统上海市野外科学观测研究站
上海市软科学研究基地
上海市美国创新与发展研究中心
上海市前沿科学研究基地
上海市基因编辑与细胞治疗前沿科学研究基地 上海市分子智造前沿科学研究基地
上海市协同创新中心
上海市可信工业互联网软件协同创新中心
